ساختار فیلوژنتیکی گونۀTrichoderma harzianum جداشده از برخی اقلیمهای ایران
چکیده
استرینهای قارچ Trichoderma harzianum بهدلیل کاربرد در کنترل بیولوژیک بیماریهای گیاهی و تأثیر بر زندگی بشر، اهمیت فراوانی دارند. در تحقیق حاضر، ساختار فیلوژنتیکی این گونه بهدستآمده از مناطق جغرافیایی مختلف و زیستگاههای متنوع در برخی اقلیمهای ایران (NC، SCD و CSW) بررسی شد. بهمنظور بررسی و غربال اولیه، انگشتنگاری 239 جدایۀ بهدستآمده از جنس Trichoderma با استفاده از نشانگر RAPD-PCR انجام گرفت. براساس گروهبندی انجامگرفته، تعدادی جدایه از هر گروه بهمنظور تعیین توالی ناحیۀ ITS1-5.8 s-ITS2 از rDNA انتخاب شدند. در مجموع، 176 جدایه از گونۀ T. harzianum بهدست آمد. از این میان، 76 جدایه که برای ناحیۀ ITS آنها تعیین توالی انجام گرفته بود، با روش ماکسیمم پارسیمونی تجزیهوتحلیل فیلوژنتیکی شدند. در نتیجه، این جدایهها در 10 فیلوتیپ (phylotype) جای گرفتند. فیلوتیپ A با یک جدایه (4414) نمایندۀ آالل جدیدی از ITS در گونۀ T.harzianum میباشد، که بومی ایران است. یافتن این آلل منحصر به فرد در اقلیم CSW در شمال ایران، میتواند بیانگر تأثیر این شرایط اقلیمی در ظهور این آلل جدید در گونۀ T. harzianum باشد.
نویسنده : بهار کریمیان، محمد جوان نیکخواه، دوستمراد ظفری، خلیل بردی فتوحیفر، شهرام نعیمیاسترینهای قارچ Trichoderma harzianum بهدلیل کاربرد در کنترل بیولوژیک بیماریهای گیاهی و تأثیر بر زندگی بشر، اهمیت فراوانی دارند. در تحقیق حاضر، ساختار فیلوژنتیکی این گونه بهدستآمده از مناطق جغرافیایی مختلف و زیستگاههای متنوع در برخی اقلیمهای ایران (NC، SCD و CSW) بررسی شد. بهمنظور بررسی و غربال اولیه، انگشتنگاری 239 جدایۀ بهدستآمده از جنس Trichoderma با استفاده از نشانگر RAPD-PCR انجام گرفت. براساس گروهبندی انجامگرفته، تعدادی جدایه از هر گروه بهمنظور تعیین توالی ناحیۀ ITS1-5.8 s-ITS2 از rDNA انتخاب شدند. در مجموع، 176 جدایه از گونۀ T. harzianum بهدست آمد. از این میان، 76 جدایه که برای ناحیۀ ITS آنها تعیین توالی انجام گرفته بود، با روش ماکسیمم پارسیمونی تجزیهوتحلیل فیلوژنتیکی شدند. در نتیجه، این جدایهها در 10 فیلوتیپ (phylotype) جای گرفتند. فیلوتیپ A با یک جدایه (4414) نمایندۀ آالل جدیدی از ITS در گونۀ T.harzianum میباشد، که بومی ایران است. یافتن این آلل منحصر به فرد در اقلیم CSW در شمال ایران، میتواند بیانگر تأثیر این شرایط اقلیمی در ظهور این آلل جدید در گونۀ T. harzianum باشد.
تعداد صفحه : 11
مشخصات فایل : 238KB / PDF
قیمت : رایگان