دانشگاه تهران به همراه دانشگاه علوم پزشکی تهران در آخرین رتبه بندی دانشگاه های جهان در سال 2011 که توسط موسسه آموزش عالی شانگهای Shanghai Jiao Tong انجام شده در میان یک هزار دانشگاه به 400 -301 رتبه دست یافته اند. به گزارش خبرنگار مهر، جدیدترین رتبه بندی شانگها که در شاخه های مختلف از جمله علوم طبیعی و ریاضیات، مهندسی/ فناوری و علوم کامپیوتری، علوم زیستی و کشاورزی، علوم پزشکی و داروسازی و علوم اجتماعی انجام می گیرد، اعلام شده است. موسسه آموزش عالی شانگهای Shanghai Jiao Tong معیارهای 6 گانه ای را برای رتبه بندی مدنظر قرار می دهد که از آن جمله می توان به تعداد دانش آموختگان دانشگاه که جایزه صلح نوبل دریافت کرده اند، تعداد دانش آموختگان دانشگاه که مدالهای علمی کسب کرده اند، تعداد پژوهشگرانی که بیشترین ارجاع مقاله را داشته اند، اشاره کرد. همچنین تعداد مقالاتی که در مجلات نیچر و ساینس به چاپ رسیده اند و تعداد مقالاتی که در دو نمایه نامه بین المللی مهم Science Citation Index Expanded و Social Sciences Citation Index نمایه شده اند و سرانه فعالیت پژوهشی هر فرد در مقایسه با حجم دانشگاه نیز از دیگر معیارهای رتبه بندی این موسسه است. 
دانشگاه علوم پزشکی تهران و دانشگاه تهران از میان 100 امتیاز در نظر گرفته شده برای هر معیار امتیازات مختلفی را کسب کرده اند. این دو دانشگاه در معیار دوم (کسب مدال علمی در حوزه های مختلف علمی) 14.4 امتیاز، در معیار مقالات نمایه شده در نمایه های بین المللی مهم 37.1 امتیاز و در سرانه فعالیت پژوهشی 17.7 امتیاز کسب کردند و در مجموع به رتبه کلی 400 - 301 دست یافتند. دو دانشگاه علوم پزشکی تهران و دانشگاه تهران در سالهای گذشته نیز در رتبه بندی حضور داشته اند و در سال 2011 رشد قابل توجهی داشتند. این دو دانشگاه تنها دانشگاههای کشور ایران هستند که در رتبه بندی شانگهای در رده زیر 500 قرار دارند. دانشگاه تهران و دانشگاه علوم پزشکی تهران در سال 2009 در رتبه 500-402، در سال 2010 به رتبه 500-401 و در سال 2011 به رتبه 400-301 دست یافته اند.
