براساس جديدترين رتبه بندي دانشگاه ها و موسسات تحقيقاتي جهان توسط SCIMAGO Institutions Rankings هشت دانشگاه و مركز تحقيقاتي وابسته به وزارت بهداشت، در فهرست موسسات علمي برتر جهان قرار گرفتند. دكتر مصطفي قانعي معاون تحقيقات و فناوري وزارت بهداشت در گفتگو با خبرنگار مهر افزود: در نظام رتبه بندي SIR، برونداد علمي هر دانشگاه يا مركز تحقيقاتي برگزيده بر مبناي هفت شاخص مختلف شامل تعداد مقالات، درصد مقالات داراي همكاري هاي بين المللي، شاخص تاثير تحقيقات، مقالات با كيفيت بالا، اختصاصي بودن تحقيقات، نرخ برتري تحقيق و داشتن نقش رهبري در توليدات علمي بررسي مي شود. وي با اشاره به جديدترين رتبه بندي SIR در سال 2013 ميلادي افزود: بر اين مبنا 6 دانشگاه علوم پزشكي تهران، شهيدبهشتي، شيراز، تبريز، اصفهان و مشهد به همراه انستيتو پاستور ايران و بيمارستان شريعتي تهران در ميان فهرست 2392 دانشگاه و موسسه تحقيقاتي برتر جهان قرار گرفته اند. معاون تحقيقات و فناوري گفت: روند رشد رتبه دانشگاه ها و موسسات تحقيقاتي حاكي از ارتقاء چشمگير جايگاه آنها بوده به گونه اي كه دانشگاه علوم پزشكي تهران با 8 رتبه بهبود به رتبه 394، دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي با 64 رتبه بهبود به رتبه 1025، دانشگاه علوم پزشكي شيراز با 75 رتبه بهبود به رتبه 1104، دانشگاه علوم پزشكي تبريز با 145 رتبه بهبود به رتبه 1386، دانشگاه علوم پزشكي اصفهان با 169 رتبه بهبود به رتبه 1448، دانشگاه علوم پزشكي مشهد با 243 رتبه بهبود به رتبه 1596، انستيتو پاستور ايران با 557 رتبه ارتقاء به رتبه 2002 و بيمارستان شريعتي تهران با 647 رتبه بهبود به رتبه 2077 در ميان دانشگاه ها و موسسات تحقيقاتي برتر جهان دست يافته اند. جدول مقایسه رتبه های دانشگاه ها و موسسات علمی تحقیقاتی علوم پزشکی در سالهای 2012 و 2013 در نظام رتبه بندي SIR ردیف نام دانشگاه یا موسسه علوم پزشکی رتبه جهانی سال 2012 رتبه جهانی سال 2013 رتبه خاورمیانه سال 2012 رتبه خاورمیانه سال2013 رتبه کشوری سال2012 رتبه کشوری سال2013 1 دانشگاه علوم پزشکی تهران 402 394 7 7 3 3 2 دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی 1089 1025 44 43 11 11 3 دانشگاه علوم پزشکی شیراز 1179 1104 51 50 13 13 4 دانشگاه علوم پزشکی تبریز 1531 1386 65 64 16 16 5 دانشگاه علوم پزشکی اصفهان 1617 1448 75 74 18 18 6 دانشگاه علوم پزشکی مشهد 1839 1596 86 84 21 21 7 انستیتو پاستور ایران 2559 2002 125 122 31 31 8 بیمارستان شریعتی 2724 2077 138 132 36 36