بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جدایههای قارچ Macrophomina phaseolina با استفاده از نشانگرهای مولکولی PCR-RFLP و RAPD
چکیده
پوسیدگی ذغالی با عامل Macrophomina phaseolina یکی از بیماریهای مهم اقتصادی میباشد که سبب کاهش عملکرد در گیاهان زراعی و باغی میشود. تعداد 33 جدایه از قارچ M. phaseolina بدست آمده از میزبانهای متفاوت مانند سویا، خربزه، لوبیا، نخود، کاج، کوکبکوهی، کیوی، پنبه و کنجد جمعآوری شدند. شدت بیماریزایی جدایهها روی بذور خربزه در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایهها از نشانگرهای مولکولی RAPD و PCR-RFLP استفاده شد. تکثیر نواحی ITS با استفاده از آغازگرهای ITS5 و LR5 تنها یک قطعه DNA 1600 جفت بازی را تولید کرد. نتایج نشان داد که با کاربرد نشانگرهای RAPD تنوع ژنتیکی بین جدایهها وجود دارد. دادههای RAPD بر اساس پنج آغازگر تصادفی در 16 جدایه، درجه بالایی از چندشکلی را در جدایههای مختلف نشان دادند. دندروگرام به روش UPGMA که با دادههای RAPD رسم شد، نه گروه در سطح شباهت 70 درصد ایجاد کرد. جدایههای که از مناطق مشابه بودند تمایل به گروههای نزدیک را داشته که نشان دادند که از نظر ژنتیکی به هم مرتبطاند.
نویسنده : اکرم بخشی، حسن رضا اعتباریان، حشمت اله امینیان، محسن ابراهیمیپوسیدگی ذغالی با عامل Macrophomina phaseolina یکی از بیماریهای مهم اقتصادی میباشد که سبب کاهش عملکرد در گیاهان زراعی و باغی میشود. تعداد 33 جدایه از قارچ M. phaseolina بدست آمده از میزبانهای متفاوت مانند سویا، خربزه، لوبیا، نخود، کاج، کوکبکوهی، کیوی، پنبه و کنجد جمعآوری شدند. شدت بیماریزایی جدایهها روی بذور خربزه در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایهها از نشانگرهای مولکولی RAPD و PCR-RFLP استفاده شد. تکثیر نواحی ITS با استفاده از آغازگرهای ITS5 و LR5 تنها یک قطعه DNA 1600 جفت بازی را تولید کرد. نتایج نشان داد که با کاربرد نشانگرهای RAPD تنوع ژنتیکی بین جدایهها وجود دارد. دادههای RAPD بر اساس پنج آغازگر تصادفی در 16 جدایه، درجه بالایی از چندشکلی را در جدایههای مختلف نشان دادند. دندروگرام به روش UPGMA که با دادههای RAPD رسم شد، نه گروه در سطح شباهت 70 درصد ایجاد کرد. جدایههای که از مناطق مشابه بودند تمایل به گروههای نزدیک را داشته که نشان دادند که از نظر ژنتیکی به هم مرتبطاند.
تعداد صفحه : 10
مشخصات فایل : 344KB / PDF
قیمت : رایگان